Невинаги приемането на антибиотици предизвика чревни проблеми. Отрицателното им влияние зависи от състоянието на организма, неговата индивидуална реакция и качеството на лекарството. Човек, който злоупотребява с антибиотици, особено без лекарско предписание, е по-вероятно да срещне неприятни прояви на дисбиоза. А и много съвременни антибиотици са по-доброкачествени и не водят до проблеми със стомашно-чревния тракт.