Някои теоретици на Великата конспирация признават съществуването на децата индиго, но отказват да повярват, че това са древни души с космическо съзнание. Те са убедени, че децата индиго са резултат на правителствени експерименти. Това приблизително започва, когато психоневрологът Андрия Пухарич се срещнал с индийския мистик доктор Винодъм, който заявил, че влиза в групата на „Деветте принципа на Бог”. Похарич работил по проект в научно-изследователския център Turkey Farm, където се предполагало, че се извършват експерименти с деца от седем страни. Целта на експеримента била да се установи, дали децата притежават способности, които да се използват за военни цели.