Главоболието може да възникне поради липса на прогестерон, друг хормон, който може да подобри настроението. Тази болка може да се прояви под формата на мигрена. Хормонът е важен по време на бременност, така че симптомите на нисък прогестерон при бременни жени могат да се различават и трябва да бъдат контролирани.