Той страдал от дефицит на растежен хормон и лечението било много скъпо, почти изразходвайки всичките им приходи. За щастие, от отбора му в Барселона се намесили и предложили да покрият разходите за медицинското лечение на Лионел. Това щедро предложение накарало Селия и семейството ѝ да се преместят в Испания, за да се грижат за сина си.
Престоят на Силия, Лионел и неговите братя и сестри в европейската страна обаче бил кратък. По-късно Селия се завърнала в Аржентина, оставяйки сина си и съпруга си. Лионел споделя: „Беше много трудно за мен. Имаше моменти, в които бях наистина тъжен и носталгичен.”
През първите три години от професионалната си кариера Лионел можел да вижда Силия и братята и сестрите си само на всеки четири месеца. Винаги, когато трябвало да ги напусне и да се върне в Испания, футболистът се борел емоционално. Бащата на Лионел, Хорхе Меси, си спомня: „Лео се нуждаеше от майка си.“