Лонгория се омъжва за първи път за колега от сапунена опера - Тайлър Кристофър от 2002 до 2004 г., точно по времето, когато изгрява в "Отчаяни съпруги". След това Лонгория се омъжва за бившия играч от НБА Тони Паркър през 2007 г., но бракът им приключи през 2011 г. на фона на скандал за многобройните изневери на Паркър. Лонгория се омъжва за настоящия си съпруг Бастон през 2016 г. Имат син Сантяго, роден през 2018 г. „Не съм фен на брака, но ми харесва да съм омъжена за него“, каза Лонгория пред „Пийпъл“ през май 2017 г. „Никога не съм мислила, че ще се омъжа отново. Той прави всичко това да си заслужава.“