Първата съпруга на Том е актрисата Мими Роджърс, с която се запознава в средата на 80-те, докато промотира „Топ Гън“. Смята се, че Роджърс, второ поколение сциентолог, е една от първите връзки на Круз с тази организация. Бившият съпруг на Мими също е сциентолог. През 1987 г. двамата се женят на скромна церемония. По това време Мими е на 31 години, а той – на 24.