Торнтън се жени за първи път за Мелиса Лий Гатлин от 1978 до 1980 г., след това за Тони Лорънс от 1986 до 1988 г. Две години по-късно жени за актрисата Синда Уилямс през 1990 г., но бракът им продължава само 2 години. Четвъртият му брак е с Пиетра Доун Черниак, с която е от 1993 до 1997 г.; следващата е Джоли от 2000 до 2003 г. Шестият му и настоящ брак е с Кони Англанд, с която започва да се среща през 2002 г., докато все още е законно женен за Джоли (обявиха раздялата си през 2002 г.). Най-накрая се ожениха през 2014 г. след повече от десетилетие заедно.