Уондър бе женен за музикантката Сирийта Райт от 1970 до 1972 г. Малко по-малко от 30 години по-късно той се ожени за втори път за модната дизайнерка Кай Милард през 2001 г. Двамата се разделят през 2009 г. и се развеждат законно през 2012 г. Уондър се жени за третата си и настояща съпруга Брейси през 2017 г.