На 20-годишна възраст Лиза се омъжила за музиканта и актьор Лени Кравиц, на когото родила дъщеря Зоуи. Бракът им продължил само шест години. Двойката се развела, но успяла да поддържа приятелски отношения.

През 2005 г. Лиза срещнала Джейсън Момоа в клуб и от този момент влюбените не се разделили. За актрисата новият избраник олицетворявал истинска мъжественост, тя се чувствала зад него като зад каменна стена. Влюбените не се женили цели 12 години, но през 2017 г. най-накрая решили да създадат семейство. Церемонията била тайна, присъствали само най-близките им хора. По време на брака им Лиза била на 50 години. Въпреки факта, че двойката обявила развода си през 2022 г., нямало скандали или „хвърляне на кал един срещу друг“. Лиза и Джейсън успели да запазят уважение един към друг и да останат добри родители заради двете си деца.